De nombreux médicaments et drogues, par leurs effets indésirables, peuvent causer des nausées, des vomissements et de la diarrhée. Une anamnèse médicamenteuse et des drogues détaillée doit être obtenue. Dans les cas bénins, l'arrêt du médicament suspect suivi de sa réintroduction permet d'établir un lien de causalité. Parmi les médicaments les plus fréquemment incriminés, il faut citer les antiacides contenants du magnésium, les antibiotiques, les antihelminthiques, les cytotoxiques (utilisés en oncologie), la colchicine, la digoxine, les métaux lourds, les laxatifs, l'immunothérapie et la radiothérapie. La consommation d'antibiotiques peut provoquer une diarrhée induite par Clostridioides difficile. La diarrhée et d'autres symptômes en cas d'infection par C. difficile peuvent être plus graves que la diarrhée associée aux antibiotiques et persister après la fin ou l'arrêt des antibiotiques.
Les intoxications iatrogènes, accidentelles ou intentionnelles par les métaux lourds entraînent généralement des nausées, des vomissements, une douleur abdominale et une diarrhée.
L'abus de laxatifs, parfois inavoué par le patient, peut entraîner une asthénie, des vomissements, une diarrhée, une perte électrolytique et des troubles métaboliques. Les tests sur les selles, en particulier la mesure de l'osmolalité des selles, peut permettre de différencier la diarrhée résultant de l'abus de laxatifs osmotiques d'une diarrhée résultant d'autres causes.
(Voir aussi Revue générale des gastro-entérites.)