Revue générale des infections virales respiratoires

• Habituellement, anamnèse et examen clinique et épidémiologie locale

• Parfois, des tests diagnostiques

Les infections respiratoires virales sont généralement diagnostiquées cliniquement sur la base des symptômes et de l'épidémiologie locale. Pour soigner les patients, le diagnostic du syndrome est généralement suffisant; l'identification de l'agent pathogène spécifique est rarement nécessaire.

Les tests diagnostiques doivent être réservés aux cas suivants:

• Situations dans lesquelles l'identification d'un agent pathogène spécifique affecte la prise en charge clinique

• Surveillance épidémiologique (c'est-à-dire, identification et détermination de la cause d'une épidémie)

L'identification des agents pathogènes peut être importante lorsqu'un traitement antiviral spécifique est indiqué. Un traitement antiviral est administré pour les virus et les indications suivants:

• Grippe: patients ou contacts étroits de patients à haut risque de complications; peut être administré aux patients à risque moyen qui présentent des symptômes pendant < 48 heures (1)

• COVID-19: patients à haut risque de maladie grave avec des symptômes pendant < 5 jours (2)

• Infection par le virus respiratoire syncytial (VRS): patients gravement immunodéprimés

L'identification de l'agent pathogène spécifique (notamment le virus de la grippe ou le VRS chez les patients hospitalisés ou résidant dans un établissement) peut également être important pour la prévention et le contrôle des infections, y compris pour identifier et contenir les épidémies potentielles.

Des tests diagnostiques antigéniques rapides et la PCR (polymerase chain reaction) sont disponibles pour la grippe, le VRS et le SRAS-CoV-2. Les tests antigéniques rapides au lit du malade ont une sensibilité inférieure à celle des tests de laboratoire basés sur la PCR (3). Les tests au lit du malade sont généralement réservés aux cas où le diagnostic clinique est incertain et

• Un traitement antiviral est envisagé.

• L'identification de l'agent pathogène viral empêcherait une évaluation supplémentaire ou le traitement d'une infection bactérienne.

• L'identification de l'agent pathogène viral faciliterait la prévention et le contrôle des infections en milieu hospitalier.

La détection par PCR (Polymerase Chain Reaction) des agents pathogènes viraux dans un panel multiplex (ou individuellement dans le cas de la grippe et du VRS) et du SARS-CoV-2 est disponible dans de nombreux laboratoires cliniques. Ces tests sont plus sensibles que les tests antigéniques au lit du malade et, lorsqu'ils sont disponibles, ils sont préférés à des fins cliniques.

La culture cellulaire ou les tests sérologiques sont parfois disponibles, mais sont plus lents que les tests PCR. Ils peuvent être utiles pour la surveillance épidémiologique.

• Soins de support

• Parfois, médicaments anti-viraux

Le traitement des infections respiratoires virales est habituellement symptomatique.

Les agents antibactériens sont inefficaces contre les pathogènes viraux et la prophylaxie contre les surinfections bactériennes secondaires n'est pas recommandée. Les antibiotiques ne doivent être administrés que lorsque des infections bactériennes secondaires se développent.

L'aspirine ne doit pas être utilisée chez les patients âgés de ≤ 18 ans qui ont une suspicion d'infection virale des voies respiratoires, du fait du risque de syndrome de Reye.

Chez certains patients, une toux persiste pendant 3-8 semaines après la guérison d'une infection des voies respiratoires supérieures (1); ces symptômes peuvent être diminués par la prise d'un bronchodilatateur ou de corticostéroïdes.

Dans certains cas, les antiviraux sont utiles:

• L'oseltamivir, le baloxavir marboxil, et le zanamivir sont efficaces contre la grippe (2).

• Le nirmatrelvir associé au ritonavir, au rémdesivir ou au molnupiravir après l'apparition des symptômes du COVID-19 peut être envisagé pour prévenir la progression vers une maladie grave chez les patients à haut risque, et le rémésivir peuvent être envisagés en cas de COVID-19 grave (3).

• La ribavirine, un analogue de la guanosine qui inhibe la réplication de nombre de virus à ARN et à ADN, peut être envisagée chez le patient immunodéprimé présentant une infection des voies respiratoires basses due à un virus respiratoire syncytial (VRS) (4).

• Le nirsevimab et le palivizumab sont des anticorps monoclonaux utilisés pour prévenir l'infection par le VRS chez le nourrisson et le jeune enfant (5, 6, 7). Le nirsevimab est préféré mais peut ne pas être disponible pour certains nourrissons; s'il n'est pas disponible, les nourrissons et les enfants à haut risque éligibles doivent recevoir du palivizumab.